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-信號通路調控網絡構建(Pathway-Network)

Demo結果

 

Demo結果解讀

圖中表明了顯著性pathway之間的關系以及發現受實驗影響的核心Pathway。

 

信號通路調控網絡構建(Pathway-Network)介紹

根據所有差異基因同時參與的Pathway之間的相互調控關系構建信號通路調控網絡,從系統的角度研究各個信號通路間的信號傳導和調控過程,在多個顯著性Pathway中發現受實驗影響的核心Pathway,以及實驗影響的信號通路之間的調控機理。

 

分析要求

KEGG富集分析的結果或者感興趣的KEGG中的pathway(pathway個數大于10)。

 

提供結果

  1. 圖片文件(Network圖),包括png,PDF格式;
  2. Cytocape文件:可以cytoscape打開進行細節調整;
  3. 文本文件:pathway之間的關系以及每個pathway對應的indegree,outdegree。

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