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單細胞測序平臺

單細胞轉錄組測序(Single-cell RNA-sequencing)是指在單細胞水平上對RNA進行高通量測序和分析的新技術。不同于常規Bulk Sequencing(組織或細胞群測序)得到的結果只是大量細胞的平均表達水平,單細胞測序能夠深入挖掘細胞特異性的信息。目前,單細胞測序已廣泛應用于腫瘤異質性、免疫微環境、神經科學、胚胎發育、細胞分化等領域的研究。

伯豪生物擁有單細胞測序的主流平臺——BD Rhapsody,10 X genomics。將為客戶提供更大規模、更加靈活、更為全面的單細胞測序服務。


伯豪生物經過6年的積累,建立了包括 SMART-seq,10X Genomics BD Rhapsody 的單細胞RNA測序平臺,為客戶提供從樣本保存、運輸、單細胞懸液制備,到單細胞分選、建庫和數據分析的一站式解決方案。目前已為來源于人、小鼠、大鼠、果蠅、斑馬魚、牛、羊等物種的臨床和科研樣本提供了單細胞測序和數據分析服務,研究成果發表在 Cell Research、Nature Neuroscience 等雜志上。伯豪生物將不斷完善技術方法和服務體系,助力客戶發表高水平研究論文。

伯豪生物單細胞測序平臺儀器設備展示

 

伯豪生物單細胞測序優勢與實驗流程展示

 

應用范圍


●腫瘤異質性

Kim C, Gao R, Sei E, et al. Chemoresistance Evolution in Triple-Negative Breast Cancer Delineated by Single-Cell Sequencing. Cell 2018, 173(4):879-893.

腫瘤免疫微環境

Zheng C, Zheng L, Yoo JK, et al. Landscape of Infiltrating T Cells in Liver Cancer Revealed by Single-Cell Sequencing. Cell 2017, 169(7):1342-1356.

神經科學

Li CL, Li KC, Wu D, et al. Somatosensory neuron types identified by high-coverage single-cell RNA-sequencing and functional heterogeneity. Cell Res 2015, 26(1):83-102.

胚胎發育

Li L, Dong J, Yan L, et al. Single-Cell RNA-Seq Analysis Maps Development of Human Germline Cells and Gonadal Niche Interactions. Cell Stem Cell 2017, 20(6):858-873

●細胞分化

Bach K, Pensa S, Grzelak M, et al. Differentiation dynamics of mammary epithelial cells revealed by single-cell RNA sequencing. Nat Commun 2017, 8(1):2128.

 

 

 消除批次間差異

細胞亞群聚類化及可視化

細胞亞群注釋

單細胞測序不同cluster轉錄本表達豐度分布統計與不同cluster 細胞數目統計

Marker基因分析

擬時序分析


擬時序GO功能注釋
擬時序分化轉錄因子調控網絡

患者之間的功能特征性差異分析
 

伯豪生物單細胞測序活動


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